No se que clase de archivos piensas meter ahi, pero dado que el tamaño máximo que permite FAT32 es 2gb, no veo razón para comprarte mejor 2 pendrives de 8gb, que te pueden costar 20€ buenos cada uno, con velocidades de escritura/lectura mucho mayores (9/12 mb/s por rejmplo ya esta bien).
Sobre los mini discos duros, por mucho que tengan mejor precio €/MB, a mi no me gustan por tamaño (me da igual que te quepan en un bolsillo, los flash los puedes llevar en el llavero si quieres) y sobre todo por la resistencia. A una memoria flash le puedes dar mil meneos que no le pasa absolutamente nada, y el trato que se da a estos bichos suele ser muy ajetreado, pasando de manos, cayendose, tirandolo en la mesa, metiendolo en una mochila/cartera suelto, etc.