Sin saber el pin que esta mal, no se sabe lo que puede ocurrir, si quieres salir de dudas, coge un polimetro, ponlo en modo continuidad, pon la punta en el pin roto, luego la otra punta lo pones en una masa, del chasis, conector atx, etc... Si hay continuidad, es una masa y no te preocupes si le falta una.
Como te dijeron, puede pasar mil cosas como te han comentado los compañeros, pero si funciona bien, detecta la grafica y la velocidad del puerto pci-e es correcta, la ram funciona bien, y la cpu en bench da el puntuaje correcto para tu cpu, no me preocuparia demasiado.
