Pues no se decir si hay algun peligro al hacer eso, en realidad solo seria necesario conectar la PS3 online unos minutos para que se sincronizasen todos los trofeos, dudo mucho que durante esos minutos puedan detectar el cfw, pero quien sabe... nunca he leido hablar sobre esto
De todas maneras si alguien contesta a tu pregunta (o si buscas informacion o preguntas en otros foros)... hay 2 escenarios diferentes para lo que quieres hacer
Uno es cuando tu consola PS3 no ha sido conectada nunca a PSN (o al menos no con esa cuenta), en ese caso los trofeos contienen un identificador de usuario generico (lleno de ceros)
El otro caso es si alguna vez (antes de instalar el cfw) conectaste esa PS3 a PSN (y con esa cuenta), en ese caso todos tus trofeos contienen el perfil de usuario online real (en vez de estar lleno de ceros tienes el identificador unico de usuario)
Eso tienes que decirlo cuando expliques lo que quieres hacer... porque el proceso de transferencia de trofeos seria algo diferente