Un sistema de archivos no depende de un soporte (PS2) sino de , generalmente ,el Sistema Operativo o en el caso de la PS2 el HDLoader.Si a sistema de archivos te refieres del HDLoader creo q nadie ( menos sus creadores ) lo saben.Sobre lo de meter Linux a la Ps2 si q se puede pero debido a q usa un sistema de archivos diferente al del HDLoader (tendriamos q formatear) una cosa mata a la otra, vamos q o tienes 2 discos duros o creo q no vas a poder usar HDLoader y Linux particionando.
SaludoS