hola, parecen un error de la pantalla, para asegurarlo, si la 3ds es de las new y tiene CFW hay un programa para ver la pantalla superior en un pc, dudo que sigan ahí las marcas. Si eres manitas y puedes desmontarla, la puedes sustituir por alguna de cierta tienda china que todos conocemos jejeje, dudo que te salga por más de 10 euros. No te recomiendo intentar tocar la pantalla que ya tienes, es una pérdida de tiempo ya que se tratará del filtro polarizador o de algún pixel dañado y es bastante complicado arreglarlo. Un saludo