Entiendo que esas dos opciones no serían los únicos sistemas del centro de entretenimiento en cuestión.
Y suponiendo que se propone la opción de las minis porque no se tendría una MD original, elegiría PS4 y emularía MegaDrive con ella. Si total, las minis también son emulación, y además con eso te quitas unos cacharros de enmedio. O si no deseas jugar a muchos juegos de esta consola, puedes tirar con el recopilatorio oficial.
O también otra cosa, sé que esto que voy a decir se ha convertido en un meme, pero si de emular consolas antiguas se trata, yo elegiría una Raspberry Pi (que de hecho tengo una para este propósito) u otro aparato similar que sea abierto, de ese modo además de Mega Drive se podrían tener otros muchos sistemas retro.