Tienes montones de hilos oficiales y revisiones de los flashcarts, donde se explica detalladamente cómo funcionan y qué se necesita.
Hace mucho que no se necesita flashear ni modificar nada para cargar copias de seguridad o ejecutar homebrew. Te compras el flashcart (R4 es uno de ellos, pero hay un millón y son todos prácticamente igual de sencillos), te compras una tarjeta de memoria, copias los datos a la tarjeta de memoria, la metes en el flashcart, el flashcart a la consola, y ya está: a funcionar. No tiene más misterio.