una vez me dejaron una R4 Upgrade Revolution for ds/dslite, en el hueco donde se inserta la microSD se veía parte del integrado y en letras blancas R4III, le instalé el firmware de R4III y me pasaba lo mismo, los últimos juegos no funcionaban.
Googleando encontré un tutorial para instalar el ymenu (que vendría a ser un firmware alternativo pero que tenía que ejecutar).
La verdad es que con este firmware iva mejor la cosa, actualizando los archivos infolib.dat exinfo.dat y savlib.dat no tenía problema a la hora de jugar a mis últimos backups.
en gbatemp hay tutos de como hacerlo y también para actualizar dichos archivos, y seguro que aki también.
otra opción sería buscar el wood para clones, cuando yo lo probé estaba la versión 1.05 pero no me guardaba.
lamentablemente ya no tengo la tarjeta y no te puedo pasar mi firmware, pero espero haberte sido de ayuda.