Pues excepto esas 2 cosas que has mencionado, no hay más diferencias... SDHC lo que de por sí es bueno, pues cada vez te costará más encontrar SD's de 2GB, y compatibilidad con DSi y 3DS...
Pero en compatibilidad con Software (juegos), van más o menos igual, o quiza incluso mejor la R4, pues el Wood se actualiza más frecuentemente...
Eso si, yo no vendería ninguna... para lo que te van a dar por ellas, mejor tenerlas en casa (se consiguen nuevas, por alrededor de 10€ la Acekard, y por menos de 2$, un clon 1:1 de la segunda).