Xorg es tu amigo, si el xorg dice que uses la ati... no le discutas. Y los privativos usan el xorg para su configuración aun sino recuerdo mal.
Eso pasa porque los privativos no siguen el estándar que deberían seguir, así que ellos son tu enemigo posiblemente :/
Si fueran de la misma compañía con drivers privativos tal vez no tuvieras problemas, siendo de distintas marcas... no puedo decirte mucho.
Aun así, puedes desinstalar los privativos de la ATI e incluso inutilizarla vía software pues los drivers que le sacaran el potencial y demás ya se los proporcionara el propio sistema virtualizado.
Y si se te queda un guioncito arriba, cambia de tty y revisas el tema si puedes que seguramente asi podras revisar mediante comandos o revisando el log el panorama ^^.
Seria conveniente seguir algun tutorial usando VT-d y tal para poder guiarte la verdad.
