Prueba a bajar antes de nada la revision del software de la Supercard 2.433 del dia 30/11 (hay una anterior del 29/11), a ver si es de eso. Esta ultima revision me parece que resolvia algun tema de velocidad, aunque si no recuerdo mal, en el faq comentaban que era para juegos de GBA.
Sino, puedes hacer el proceso que comentan mas arriba. Otra cosa que puedes intentar es formatear la tarjeta SD por si tuviese alguin tipo de fragmentacion de sucesivos cambios de roms.