Gracias por responder, hoy he conseguido hacer funcionar el dualshook por bluetooth usando sixpair y sixad desde consola por algún motivo la GUI no tira. Lo de parchear y compilar bluez no me mola nada, prefiero mantener el bluez de repositorios que se mantiene actualizado y libre de problemas con otros paquetes. De todas maneras sigo teniendo curiosidad por saber de algún otro gamepad que tire sin hacer nada mas que conectarlo.
Por si alguien le ayuda esto fue lo que hice para usar el Dualshook en Kubuntu 13.04
sudo add-apt-repository ppa:falk-t-j/qtsixa
sudo apt-get sixad
sudo sixpair (Con el mando conectado por USB)
sudo sixad -s (Con el mando desconectado por USB)
Por ultimo pulsar el botón PS y ya estará listo para usarse.
Para parar sixad desde otra terminar escribir sixad -stop
Esto ultimo es necesario porque sixad se adueña del bluetooth y no permite que otros dispositivos se conecten por el.