Los overclocks automaticos de las placas como el PBO suelen ser para dar mayores puntuación en los benchmarks pero meten mucho voltaje, sería mejor hacerle un overclock manual al procesador que podrías incluso sacarle mejor rendimiento con oc manual, sobre si la placa aguantaría o no, no te se decir de stock aguantará pero con oc no lo se.
Sí quieres cambiar la placa podrías comprar una asus strix b550-f o MSI B550 Tomahawk mucho más baratas que las x570 que has puesto y funcionarían perfectamente con un 3900 incluso con oc y sí tienen huecos para dos m.2. Si quieres una x570 cualquiera de las dos Asus rog strix que has indicado te iría bien.