Normalmente ese tipo de programas guardan la información en una tabla de la base de datos, ya sea mysql o postgre (creo que por defecto gnupanel usar postgre).
Entra en la base de datos, busca la tabla de usuarios y, como poco, sabrás el nombre de usuario que ha puesto, y seguramente podrás calcular una nueva contraseña.
También puedes restaurar la base de datos anterior, si tenias copia justo de antes que tocara nada tu "amigo".
Pd: Te estoy hablando como trabajan otros programas como kloxo o cpanel, me imagino que en este sera similar.
