Primero revisa el disco duro con algun programa para revisar si esta en buen estado, quiza ya este fallando.
Segundo, si quieres ver las particiones del disco puedes usar el PS2OS en modo red para copiar o borrar entre discos -pc o el PS2-.
Tambien puedes usar el servidor FTP ExecFTP que corres en la PS2, en la PC usas un cliente FTP como el FlashFXP o el WS_FTP y puedes leer/modificar archivos de las MC, Disco duro y hasta leer archivos de un disco optico que este en la consola en ese momento.
Por aqui hay un tema que habla de todo sobre red que te puede servir y tambien otro que hice hace tiempo hablando de este programa.