Debería funcionar.
El OSCDIMG lo puedes descargar de Microsoft; viene dentro del paquete Windows 8.1 ADK (
http://www.microsoft.com/es-es/download ... x?id=39982). Sólo necesitas instalar las herramientas de implementación.
Para rehacer la ISO, debes primero volcarla a una carpeta del disco duro (digamos C:\w81). Luego desde el intérprete de comandos de las herramientas de implementación ejecutar el OSCDIMG.
oscdimg.exe -h -m -o -u2 -udfver102 -bootdata:2#p0,e,bc:\w81\boot\etfsboot.com#pEF,e,bc:\w81\efi\microsoft\boot\efisys.bin -lWin81 c:\w81 c:\w81.iso
Donde:
-h : Incluye archivos y carpetas ocultos.
-m : Ignora el tamaño máximo de imagen.
-o : Optimiza el espacio incluyendo los archivos duplicados sólo una vez (Se pueden poner -oc para que la comparación sea binaria. Más efectiva pero más lenta)
-u2 : Genera una imagen ISO que solo tiene el sistema de ficheros UDF.
-udfver102 : Utiliza el sistema UDF revisión 1.02 (Soportado por Windows 98 y posteriores). También se puede poner -udfver150 para la revisión 1.50 soportada por Windows 2000 en adelante o -udfver200 para la revisión 2.00 soportada por Windows XP en adelante.
-bootdata : Especifica que la imagen es arrancable.
-l : Etiqueta de volumen
c:\w81 : El directorio de origen de los ficheros
c:\w81.iso : El nombre del archivo de imagen resultante.
Argumentos de la información de arranque (bootdata):
2 : Especifica el número de entradas de arranque.
# : Separador
p0 : Establece la primera ID de arranque. 0 es la entrada de arranque por defecto para BIOS.
e : Especifica la emulación de disco floppy según la especificación "El Torito".
-bc:\w81\boot\etfsboot.com : Pone el archivo (Etfsboot.com) en el sector de arranque del disco. Este archivo es el que se ocupa de arrancar el DVD en modo BIOS.
# : Separador
-pEF : Establece la ID de arranque número EF (239). EF es la entrada de arranque por defecto para UEFI.
-bc:\w81\efi\microsoft\boot\efisys.bin : Pone el archivo (Efisys.bin) en el sector de arranque del disco. Este archivo es el que se ocupa de arrancar el DVD en modo UEFI.
Respecto a lo que preguntas, el Windows cuando se instala en una UEFI hace varias particiones. Generalmente una de arranque, otra que llama "Partición de sistema UEFI" y en la que instala el Windows propiamente. Todavía estoy investigando qué leches es la "Partición de sistema UEFI" y para qué sirve, así que más no te puedo decir.