Churly deberías probar XFS. Muchos aseguran que es lo mejor que se puede poner, por delante de Ext3, ReiserFS y JFS. Yo lo he tenido durante año y medio y cuando me ha pasado algo como lo tuyo ha hecho un chequeo rápido y nunca he perdido datos (al menos que me haya enterado). Lo bueno es que últimamente, el kernel de muchas distros viene parcheado con XFS para poder soportarlo, sin tener que andar haciéndolo a mano.
Yo uso ahora mismo ReiserFS 3.6, porque uso las 2.4.20-gentoo-sources que me van mejor que las xfs-sources. He tenido un apagón hace un par de días y no lo ha pillado en mal momento y ha iniciado sin problemas.
Saludos.