A ver, es imposible que el quitar las rejillas haga que la xbox se caliente mas, en todo caso se calentará menos al tener una refrigeración mas efectiva debido a que quitas obstaculos que obstruyen la salida del aire.
Ahora si realmente quieres dejar la xbox mas silenciosa sin cambiar el ventilador, te diré que no quites la chapa interior, ya que esta sirve de masa para toda la placa base, y podrás notar interferencias. Lo que si te aconsejo es que cortes el metal con tijeras de chapa o una sierra por la zona donde está el ventilador, pero no quites nada mas. Deja las rejillas de plástico puesto que estas hacen una función de protección.
Luego si realmente quieres eliminar ruido lo mejor que puedes hacer es cambiar el ventilador por uno de 80mm que sea silencioso.
Saludos!