Instalé el MPD, probé a apagar el PC para ver si mantenía el punto y efectivamente seguía desde dónde lo dejé.
Lo que otro reproductor, "clementine" también me mantuvo el punto de reproducción en otra pista. Aunque esta mañana lo he comprobado de nuevo y en lugar de empezar donde lo había dejado, empezó dónde había hecho la prueba :S
Poltergeist de los reproductores.
Muchas gracias por la ayuda.