Aparte de Mplayer solo está geexbox y después también puedes probar WiiLinux y cualquier reproductor.
Sobre lo que comentas, como te dicen por aquí, si las particiones son primarias las reconoce todas (en FAT también), asi que si no la tienes primaria, quizás deberías formatear. En todo caso, postea en el hilo oficial de Mplayer porque yo creo que aunque no sean primarias debería funcionar, Rodries ya te dirá algo.
