Es un bug, le pasa a mucha gente y, la verdad, muy puñetero. A mí me pasó también, lo que hice, fue repetir una y otra vez intentando aguantar lo máximo posible, intenté desconectar y conectar el mando ( juego con uno de 360 ) y en una de las veces volvió a funcionar.
Prueba conectar y desconectar el mando, repite la misión ( no entera, sino por esa parte ) muchas veces y cambia configuraciones tipo resolución, se la bajas por ejemplo a 720p.
A ver si tienes suerte y te funciona.