@gokussgod Claro porque ese tipo de carpetas no son de "configuración" vamos haber si se explicarme....
Restaurar sistema suele borrar por regla general todos los archivos/configuraciones que realizan cambios en el sistema.
Es por eso que muchos programas se borran por completo (de otros sin embargo quedan restos de archivos que no realizaban cambios en el sistema) y otros incluso quedan 100% intactos (suelen ser los "típicos"portables).
A ojos de Windows la carpeta incoming donde están las descargas del emule es.....una simple carpeta "Descargas" con cosas del usuario. Es por eso que te la ha preservado intacta
En definitiva:
Carpeta Usuario = Sagrada no se toca
El resto de carpetas = si hay archivos que realizan cambios en el equipo las borra y si no pues puede dejarlas total o parcialmente.
La verdad es que Restaurar sistema es un poco lioso la teoría es fácil = se tocan archivos de configuración y se devuelven a su estado anterior.
En la practica depende de varios factores que archivos toca y cuales no digamos que lo único seguro es que la carpeta Usuarios (Escritorio, Imágenes, Documentos, Vídeos, Descargas) no se toca y el resto de carpetas ya no es seguro de si las toca o no (dependes de varios factores) como por ejemplo si era un archivo del que el sistema guardaba copia automáticamente o de si realizaba cambios ect...
Ademas para añadirle más inri al asunto los criterios que usa windows para decidir si un archivo debe o no borrarse han ido evolucionando minimamente entre versiones lo unico que se ha mantenido siempre desde Windows XP es Carpeta de Usuario = Sagrada
Saludos