Por lo que he leído y observado me aventuro a decir lo que creo que pasa: el mando responde de forma instantánea, pero la programación de algunas funciones de juego hace que no se vean al instante, porque la consola tiene que saber qué es lo que quieres hacer exactamente.
Poniendo un símil, la pulsación de un botón llega al mando y de ahí a la consola al instante, pero si juegas a un Street Fighter, no puedes hacer la bola hasta después de hacer "abajo, diagonal, derecha, puño", y por tanto, desde que haces "abajo, diagonal" hasta que sale la bola hay cierto "lag". Pero todos sabemos que no afecta al juego.