Muchas gracias, Skelton, ya lo he resuelto.
Mackid, supongo que tu problema será el mismo que el mío, asi que te cuento. El problema son las versiones de roms, ya que el aFBA no es compatible con las ultimas versiones de roms para MAME. Tienes que abrir el .zip de la rom y ver que archivos tienen, para que funcionen en aFBA, las roms de CPS3, tienen que tener varios archivos con la siguiente estructura:
XXXX-simmY.Y
Donde XXXX es el nombre del juego (sfiii, sfiii2, sfiii3, jojo, redearth, etc) y las Y son valores numericos, por ejemplo, para Street Figther III 3rd, serian:
sfiii3-simm1.0
sfiii3-simm1.1
etc
Con esa estructura funcionan sin problemas en aFBA.
Un saludo!