Por poner el HD de la PS2 en el PC no hay ningún riesgo. Todo depende lugo el programa que utilices para leerlo y lo que quieras hacer con él. Me explico, si vas a meter juegos no hay ningún problema, utilizas el winhiip y perfecto. En cambio, si quieres meter pelis o cualquier otra información, había un programa para entorno windows que te dejaba leer y gestionar la estructura de tu HD de PS2, pero era un poco peligroso porque ese programa no funcionaba del todo bien y te podía joder la información.
En cuanto a lo del USB yo no lo he visto, lo que suele hacer la gente es sacar el HD de la PS2, montarlo en en una carcasa, de manera que lo convierte en un HD externo, lo enchufa al PC por USB y a pasar juegos.
Un saludo!!