Los pixels será pq no tienes suficiente bitrate puesto, si quieres conseguir buena calidad , pone doble pasada , y dependiendo del avi que sea , mas o menos de referencia puedes cojer que para uno de aproximadamente 1h y 30min , el bitrate es de 950-1000 (en Xvid y Divx)
Lo de que ves en canal plus
es porque el video está etrelazado , tienes que dar la opcion de entrelazar cuando vayas a convertirlo , porque si no pasa eso del canal plus , cuando hay mucho movimiento se ven muchas rayas que no sabes ni de donde han salido xD
Haber si lo que te he dicho sirve de algo