Te comento varias partes desde mi experiencia:
La bomba no hace falta una gran regulacion, yo tengo una regulacion a dos alturas, una en reposo y otra en carga. Las placas tienen su conector propio para la bomba (pump). Y yo tengo regulada esa velocidad por la temperatura del proce.
Seria interesante que pusieras la configuracion del loop y las piezas a montar en el equipo. En mi equipo tras muchas pruebas el procesador siempre se calienta mas que la grafica, por tanto la bomba va regulada por el proce. Yo tengo 2 radiadores de 240 justo después de cada disipador y los ventiladores los tengo regulados tomando temperatura de cada componenete, O sea el que esta detras de la grafica lo regulo sobre la temperatura de la misma, y el que va detras de la cpu regulo con la temp de la cpu.
En tu configuracion imagino que sera BOMBA-GPU-CPU-RADIADOR-DEPOSITO, si es asi te recomiendo regular tanto bomba como ventiladores tomando la temperatura del proce que sea el mas caliente.