Dos cosas:
Primero comprueba que en el surreal.ini justo abajo de la línea "Rom Path=E:\Roms" has configurado la línea "Media Path=" con el sitio donde esta ubicada la carpeta media del emulador (el ultra.ini yo no lo modifiqué para que me funcionara), segundo, a mi la primera vez que lo instalé no me aparecian las roms tampoco, lo que hice fue borrar desde el gestor de partidas del dash de M$ lo que aparecia del Surreal, cuando lo hice y actualicé desde el emulador ya me aparecieron