Yo lo hago con el programa nPort.
Te explico...
Tengo la ip de la Ps2 como 192.168.0.10 y en el pc pongo la direccion ip y la puerta de enlace predeterminada a 192.168.0.1
Entonces arranco la Ps2 en la cual me sale el Keylancher, desde el cual ejecuto el programa Ps2Link.elf (eso es lo que te interesa, poder ejecutar el Ps2link o el Pukklink, da igual si es a traves del keylancher o de otra forma)
Una vez ejecutado el Ps2Link, me voy al pc (tengo que tener la ps2 y el pc conectado por el cable de red) y ejecuto el programa que tengo que haber instalado, el InLink.
Luego, en el programa InLink, le doy al boton Run, y busco el fichero: nPort.ELF
Desde hay ves las partidas de la mc y el directorio del pc, es cuestion de copiarlas, moverlas, borrarlas....
Eso es como yo lo hago hasta hoy.... pero me estoy peleando por instalar el uLaunchelf para pasar las partidas de la mc al hdd0, asi me ahorro enchufar la ps2 al pc.
Un saludo!