Para actualizar los juegos en pkg lo que hay que hacer es, resumiendo:
1- Hay que crear dos pkg: uno que sera el primero que pongamos y otro que sera el último
2- En este segundo pkg pondremos, en el PARAM.SFO, una versión superior a la de la última oficial del juego (Por ejemplo, si la última actualización es la 2.0, en nuestro pkg pondríamos, por ejemplo, 2.1)
3- Instalamos el primer pkg e instalamos el juego normalmente.
4- Instalar las actualizaciones en orden. (El pkg instalado desaparecerá)
5- Cojemos el segundo pkg creado con el eboot modificado
6- Ejecutamos el juego y ¡A jugar!
Lo he probado en Heavy Rain y funciona, si interesa a más gente puedo hacer una relase del método en condiciones.... Un saludo.