A mi tambien me ha pasado en varios juegos, no se que ocurre pero son bugs de los loader o algo asi.
Antes ocurria de vez en cuando pero ultimamente esta pasando demasiadas cosas raras, a uno se le desaparecen los juegos (me paso a mi con el Assassins hermandad) a otros le sale datos dañados, a otros se le joden o desaparecen los savedatas, etc...
Yo he estado jugando a backups de juegos de 3.55 para atras y no pasaba nada, nunca, todo funcionaba correctamente y a partir que salio el Dragon age 2 y algunos juegos parecidos que tienes que modificar archivos como el eboot, param, etc.. para que funcione estos juegos he tenido varios problemas y a mucha gente igual.
No se, quizas si tocas demasiadas cosas para que te funcionen los backups al final salen estos bugs tan extraños.