El fluorhídrico reacciona con el silicio del vidrio formando fluroruro de silicio, en la wikipedia lo explican. Se utiliza para grabar el vidrio como dices, pero he tenido bastantes prácticas en laboratorio y no hemos llegado a utilizar fluorhídrico porque los vapores al reaccionar son bastante peligrosos, y eso que manejamos los ácidos debajo de una campana de gases...
Te recomendaria no utilizarlo pero también depende mucho de la concentración que tenga, pero si lo vas a utilizar, que sea lo más diluido que puedas y en un sitio muy ventilado como dicen, si pudieras pillarte alguna mascarilla mejor. No utilices ningun recipiente de vidrio y utiliza guantes, siempre se derrama un poco de liquido cuando lo viertes de una botella y a mi me ha caido alguna vez ácido en la mano bastante diluido y jode bastante.