Creo que podrias de la siguiente forma (que conste que NO he probado nada de lo cuento, pero si solo haces lo que te digo NO puedes romper la ps3):
Una vez preparada la ps3 para instalarle el linux, en ese momento de los manuales en los que te pone "meter dvd", apagas la consola y sacas el hd. Montas el hd en un pc, no se si sera necesario tener linux, y vuelcas el contenido de un live cd de linux (algunas distros lo tienen bien explicado). Vuelves a montar el hd en la ps3, y ya esta.
Problema: estas distros no estan diseñadas para soportes con escritura, por lo que puede que algunas cosas vayan lentas.
Solucion: una vez montado el hd en el pc veras que hay dos particiones, la de la play (no se el formato) y otra sin formato o con ext3. Pues necesitas mantener la particion de ps3 y la otra la divides en dos, en una, la mas peque (con 1G deberia sobrar) vuelcas el live cd. Desde el linux del live cd podras instalar linux en la otra particion, sabiendo que una vez instalado puedes eliminar la particion del live cd para redimensionar una de las otras dos o usarla como otro hd.
PD: tb puedes volcar alguna mini-distro que solo tenga lo minimo Y el controlador USB, con lo que podras tb instalar desde un usb, pero el proceso seria el mismo.
Espero ser de ayuda. Y si lo pruebas y funciona, comparte la experiencia.
EDITO: mira tb este hilo, que te puede ayudar mucho.