Yo ahí lo que veo es que la versión de 32X va más rápido, tiene mejor framerate, parece que el personaje se controla mejor (no lo he probado), tiene mejores gráficos y la calidad sonora es mejor (se nota mucho en los efectos de sonido)... pero la música es una bazofia, no sé a quién se le ocurriría utilizar el chip de sonido de esa forma, la versión de SNES tiene mucha más fuerza, más vida.
Eso si, es impresionante que una SNES pudiese mover eso, una pasada, además de que tengo entendido que está completo, no como el de 32X... que manda huevos.
Pero bueno, a lo que íbamos: el chip de sonido de la 32X es bastante superior al de SNES, lo único que ocurre es que ahí está utilizado de forma horrible. Podéis escuchar algunas de las melodías del Knuckles Chaotix por ejemplo para haceros una idea, y seguro que hay ejemplos mejores, pero no conozco apenas el catálogo del add-on.