Gnu/Linux por el sistema de paqueteria centralizada desde donde descargaras el 95% de las aplicaciones las cuales han sido analizadas, testeadas, etc. No te liare con temas de permisos avanzados ni nucleos ni nada mas
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Ademas, tiene su código disponible para su revisión, en Mac... solo cuando a ellos les de la gana y muchos programas que te descargues a saber de donde salen ni quien los ha modificado
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Ademas, La licencia de Mac OS X vale pasta y el sistemas es mucho menos configurable ni personalizable sin contar que tiene muy poco hardware compatible :S
Por su parte para Mac ya se han visto mucho falso antivirus y programas "gratuitos" (este año ya me toco desinfectar uno :/) ademas de programas de propaganda, en GNU/Linux no veras de ello, si eso alguna extensión para navegador pero eso ya es en cualquier sistema
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. Es tal vez lo que mas podria fastidiar al usuario basico.
Despues Mac OS X tiene puertas traseras para el gobierno estadounidense, los de su compañia, etc... los GNU/Linux habituales, no, ventajas de poder examinar el codigo ^^.
Luego si quieres hay distribuciones de GNU/Linux y modificaciones que puedes realizar que ni mac ni Windows podrían llegar a alcanzar, de ahi su uso en los sistemas de mayor seguridad y estabilidad a nivel mundial.