bueno, por pasos:
tener el backup launcher en una app del canal Homebrew o en un canal instalado es lo mismo, lo unico que cambia es el origen desde donde carga. Por tanto, el tema del bloqueo de actualizaciones no lo pierdes por no cargarlo desde el Canal Homebrew.
Para crear el canal se usan metodos poco legales, modificando datos de Nintendo y estas cosas. En realidad solo es ilegal distribuirlo, asi que si quieres hacerte uno, tu mismo, pero no lo cuelgues. Por otro lado, por ahi hay algunos ya creados y comprobados que funcionan, ya que es complicado y te puede suponer un semibrick.
Mi consejo: ya que vas a instalar material en la máquina, yo te recomendaria usar softmii o similares, en el que no necesitaras un canal para tus juegos, si no que los cargaras desde el canal disco, pasate por el foro e informate
un saludo!