Si te refieres a los edificios que aparecen "sólos", debes indicar al crear la zona (residencial, industrial o comercial) el sentido de las construcciones (te lo dice la flecha que aparece en la zona, al menos con la expansión Rush Hour). Puedes cambiar esa orientación pulsando la tecla ALT y si la zona es muy grande, cambiar la distribución de las carreteras que aparecen dentro automáticamente pulsando la tecla MAYÚS (o combinar ambas teclas). Aunque lo mejor es no crear zonas enormes y ajustarlas así mejor a la planificación que quieras.
Respecto de los edificios que se colocan directamente (policia, escuelas, etc) el único requisito (que recuerde) es que deben tener acceso directo a una carretera y su orientación es automática, pero no sé si puede cambiarse cuando hay más de una orientación posible. Prueba pulsando también ALT, por si acaso.
Un saludo.