Hola, veamos.
Yo tengo en la sección ServerLayout:
InputDevice "Raton" "SendCoreEvents"
InputDevice "Touchpad" "CorePointer"
InputDevice "Keyboard1" "CoreKeyboard"
Tienes que poner uno como CorePointer y otro como SendCoreEvents, normalmente el touchpad q esta fijo como principal y el raton externo como secundario.
El problema ahora es encontrar el dispositivo de cada uno. Yo tengo el touchpad en psaux y uso un raton usb con /dev/input/mice. Lo que no sé es si teniendo dos ps2 habra psaux1 o algo similar, sera cuestión de investigar. No tienes un raton usb?
Un saludo y suerte.