Hola, poderse se puede, pero tendras varios problemas, le tendras que colocar igualmente el interruptor para seleccionar una unidad u otra, como bien an dicho el conector de la unidad de portatil es mas pequeñao pero se pueden conseguir adaptadores a ide, ten en cuenta que estas unidades tarbajan a 5V y la tension le entra por el mismo conector, si no recuerdo mal hay unos micro pc que se llaman "ZPC" que tienen un disco de portatil y una unidad adaptadas al ide convencional, la verdad que con el curro que lleva no se si te meresera la pena, pero suerte.
Un saludo