Hombre, sobre los comandos de linux y demás, yo te aconsejo que te instales por ejemplo en una máquina virtual (para no liarla en el servidor), cualquier distro sin entorno gráfico y vayas haciendo cositas para aprenderte los comandos básicos y su sintaxis, dedicándole algo de tiempo no deberías tardar mucho en manejarte. Sobre Plesk, pues en la "Reseller's Guide" (si no la tienes o encuentras te la paso, pero no creo que sea muy difícil de encontrar en internet), aunque es algo escueta, viene básicamente todo lo que necesitas saber, lo demás es adaptarlo a tus necesidades.
Un saludo.