Es posible, a mi me ha pasado, que estes hablandole con los altavoces encendidos en ved de con auriculares. Entonces el sonido de los altavoces vuelvo a entrar en el microfono.
También es posible que tenga hotmail abierto en su pc a la vez que skype, ya que recientemente han puesto la opción de recivir/realizar llamadas mediante la web de hotmail tambien. Puede que esa sea la causa!!
un saludo!