Aunque arrancase bien, no funcionaría, ya que el emulador busca las roms en la unidad de CD, y no hay manera de hacer que las busque en el disco duro. Bueno, si, modificando el codigo, siempre y cuando sepas, y que el codigo del emulador esté liberado. Si tienes chip, pues hazlo desde cd's...
De momento, solo hay dos o tres emuladores que van desde el disco duro perfectamente.
PGen (Mega Drive)
Neo Geo CD (He leído que funciona, no os lo puedo confirmar)
Atari 2600
Hay un usuario de ciertos foros de otra web que está modificando el código de casi todos los emuladores para darles soporte en el disco duro. Espero que se lo curre