Hay una teoría de lectores que dice que es mejor tener un disco siempre dentro, para que la lente acumule el menor polvo posible. Como el polvo "cae", al ser la posición horizontal la más corriente, el disco en el interior hace de "paraguas" que recoge el polvo evitando que llegue a la lente.
Ahora bien, como en la wii, la posición más común es la vertical, yo creo que da exactamente lo mismo. En mi caso siempre hay uno dentro, tal como han dicho antes, sacar el juego, hace que pierda la gracia el botón de encendido incorporado en el mando.
Saludos.