Pues la unica manera que se me ocurre, para regular la velocidad del ventilador, es cambiar el voltaje que le entra. Si decis que se nota en el ruido, debe ser que cambia su voltaje.
El ventilador que tiene la xbox es de 12v. Lo que sucede es que por defecto esta alimentado a 7v. por eso va tan despacio. Supongo que sera para aumentar la vida del mismo, y reducir el ruido.
Hay por ahi algun tutorial para poner la alimentacion a 12v. Cambiando un cable de sitio.
Saludos