No se puede generalizar. Hay juegos que efectivamente no se pueden usar con el cable VGA (que yo haya probado por ejemplo Futurama, Simpsons Road Rage) y no queda más pelotas que jugarlos por componentes.
Hay otros que aún viéndose con el VGA lo hacen sin ocupar toda la pantalla (Pro Evolution 5 y Prince of Persia Sands of Time por ejemplo), y hay que usar componentes para velo a pantalla completa.
Y hay otros que se ven de puta madre en HD con el cable VGA (Halo 2 o Grand Theft Auto San Andreas por un poner). El caso de Halo 2 es curioso porque el juego en si va de puta madre, pero cuando hay que actualizar o nos queremos bajar los mapas extras, no queda más cojones que poner el cable por componentes, porque se torra al sacar el dash de la Xbox 1 para estas actualizaciones. Una vez actualizado podemos volver al VGA HD sin problemas
En respuesta a tu pregunta, lógicamente son defectos del emulador que es de esperar vayan puliendo con las sucesivas actualizaciones relativas a retrocompatibilidad.
Salu2 !