Yo tengo mi stick de 4gb en FAT32.
La FAT16 si soporta 2gb, 4gb, etc... lo que NO SOPORTA, es que **1** solo archivo sea mayor a 4gigas, pero si son varios de pesos menores (3.99gb por ej.) no hay problema.
lo otro es que, en teoria, el fat16 va más rapido, aunque los archivos pequeños ocuparan mas por el asunto de los bloques.