Sip, a pesar de que EXT3 soporta archivos de más de 2 Gb hay muchos programas que fallan con este tipo de archivos. Bueno, teniendo en cuenta que EXT2 si que tenía esa limitación (o eso tenía entendido) no es algo tan ilógico.
Ahora mismo se me ocurre el wget y el d4x, que tambien le era imposible pasar de los 2 Gb. ¡Ah! Y el samba creo que tambien, intenté pasar un archivo de 4 Gb a un protátil por samba y se paró justo en 2 Gb, aunque no sé si esto es más por limitaciones del protocolo que del programa en sí...