Si 12V te parece muy ruidoso puedes colocar un potenciómetro para regular el voltaje que reciben los ventiladores a tu gusto...
En cuanto a los riesgos... aparte de la pérdida de garantia...
El consumo de la xbox slim es bastante ajustado:

Además las fuentes de alimentación suelen tener cierto margen de corriente con los que podrías alimentar un ventilador extra... teniendo en cuenta los puertos USB o el de kinect que normalmente no se usan ya tienes varios amperios de margen...
En resumen, salvo que estés con un juego que sea exigente para el hardware y/o utilizando muchos periféricos al mismo tiempo, el funcionamiento de la consola no se vería afectado, en el caso de que no tuviera alimentacion suficiente esta se apagaría o tendría un comportamiento inestable, pero el "daño" repercutiría en la fuente de alimentación al trabajar por encima de sus posibilidades (se notaría que se calienta mas de lo normal hasta que casque...)
Si utilizas un ventilador de menos de 500mA no creo que tengas problema alguno.
Salu2