Tienes que instalar tanto windows como linux en modo UEFI para que puedas tener el arranque dual, si instalar linux en un modo que no es UEFI no te va a reconocer grub el arranque de windows... y tendrías que arrancarlo con F12 seleccionando el disco dondes está windows, te lo digo porque yo tengo Windows y Linux en discos distintos, lo que creo que te está pasando es que no te incluye la particion de windows en el grub por este motivo.
