Bueno, resulta ser que el problema era que decía que el cIOS estaba bloqueado, tuve que seleccionar el 222 (el 249 me daba el mismo error) y perfecto.
Mi problema ahora está en si es normal que el CFG Loader me de error al cargar y deba presionar A y desde ahí la SD para que reconozca el juego, o si hay otra forma más amigable de hacerlo, más que nada para que mis sobrinos sean capaces de cargar el juego sin tanta complicación.